Protein–RNA interactions for Protein: Q12454

OCA6, Putative tyrosine-protein phosphatase OCA6, yeastyeast

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OCA6Q12454 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 YML6YML025C 861 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 UTR2YEL040W 1404 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 EFT2YDR385W 2529 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 EFT1YOR133W 2529 nt6.64□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 CYC8YBR112C 2901 nt6.63□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 CRP1YHR146W 1398 nt6.63□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 LAG2YOL025W 1983 nt6.63□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 ERG8YMR220W 1356 nt6.62□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 HEM2YGL040C 1029 nt6.62□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.62□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 OM45YIL136W 1182 nt6.62□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 MHT1YLL062C 975 nt6.62□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 YAR064WYAR064W 300 nt6.62□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.62□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 FBA1YKL060C 1080 nt6.61□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 YHK8YHR048W 1545 nt6.6□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 KEL1YHR158C 3495 nt6.6□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 COX10YPL172C 1389 nt6.6□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 snR82snR82 268 nt6.6□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 GPI11YDR302W 660 nt6.6□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 ATG36YJL185C 882 nt6.6□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 CCT8YJL008C 1707 nt6.59□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 YDR187CYDR187C 519 nt6.59□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 GAL83YER027C 1254 nt6.59□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 DFR1YOR236W 636 nt6.59□□□□□ -1.35
OCA6Q12454 RFC4YOL094C 972 nt6.58□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 MOD5YOR274W 1287 nt6.58□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 OSW2YLR054C 2175 nt6.58□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 THI2YBR240C 1353 nt6.57□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 RSA4YCR072C 1548 nt6.57□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 YJR146WYJR146W 354 nt6.57□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 DRE2YKR071C 1047 nt6.57□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 YBR027CYBR027C 333 nt6.57□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 NMD5YJR132W 3147 nt6.56□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 EDE1YBL047C 4146 nt6.56□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 CDC1YDR182W 1476 nt6.56□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 COX9YDL067C 180 nt6.56□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 VMA3YEL027W 483 nt6.56□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 YLR184WYLR184W 348 nt6.56□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 CTF19YPL018W 1110 nt6.56□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 YPL136WYPL136W 369 nt6.56□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 ATG22YCL038C 1587 nt6.56□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 POP1YNL221C 2628 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 RMD9YGL107C 1941 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 PFK2YMR205C 2880 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 RPP1YHR062C 882 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 POR2YIL114C 846 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 OAC1YKL120W 975 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 OGG1YML060W 1131 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 YPL257WYPL257W 582 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 TAE1YBR261C 699 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 STB5YHR178W 2232 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 SKI2YLR398C 3864 nt6.55□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 YDR514CYDR514C 1452 nt6.54□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 CCC2YDR270W 3015 nt6.54□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 FAL1YDR021W 1200 nt6.54□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 CUP2YGL166W 678 nt6.54□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 SQT1YIR012W 1296 nt6.54□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 MIA40YKL195W 1212 nt6.54□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 MSO1YNR049C 633 nt6.54□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 ESC8YOL017W 2145 nt6.54□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 KTR5YNL029C 1569 nt6.53□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 YLR312CYLR312C 1197 nt6.53□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 YNL120CYNL120C 486 nt6.53□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.53□□□□□ -1.36
OCA6Q12454 YGR054WYGR054W 1929 nt6.52□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 ARE2YNR019W 1929 nt6.52□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 VPS61YDR136C 573 nt6.52□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 YGR127WYGR127W 939 nt6.52□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 LYS1YIR034C 1122 nt6.52□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 SRL2YLR082C 1179 nt6.52□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 YLR123CYLR123C 330 nt6.52□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 SGF29YCL010C 780 nt6.52□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 UIP5YKR044W 1332 nt6.51□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 PTC3YBL056W 1407 nt6.51□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt6.51□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 IMD1YAR073W 1212 nt6.51□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 KSH1YNL024C-A 219 nt6.51□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 PTC4YBR125C 1182 nt6.51□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 MSY1YPL097W 1479 nt6.51□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 MPC2YHR162W 390 nt6.5□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 ICT1YLR099C 1185 nt6.5□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 ZWF1YNL241C 1518 nt6.5□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.49□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 QCR6YFR033C 444 nt6.49□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 YLR463CYLR463C 552 nt6.49□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 YMR122CYMR122C 375 nt6.49□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 RUF23RUF23 254 nt6.49□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 YMR279CYMR279C 1623 nt6.49□□□□□ -1.37
OCA6Q12454 AFG1YEL052W 1530 nt6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 100.9 ms