Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 YDR387CYDR387C 1668 nt5.89□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 IRC11YOR013W 471 nt5.89□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 YBR124WYBR124W 360 nt5.89□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 COQ1YBR003W 1422 nt5.89□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 GPD1YDL022W 1176 nt5.88□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 ASF1YJL115W 840 nt5.88□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 HSP150YJL159W 1242 nt5.88□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 PPH22YDL188C 1134 nt5.87□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 FMO1YHR176W 1299 nt5.87□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 TEL2YGR099W 2067 nt5.87□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 STT3YGL022W 2157 nt5.87□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 ESC8YOL017W 2145 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 LCL3YGL085W 825 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 YKL102CYKL102C 306 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 YNL092WYNL092W 1203 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 YOR111WYOR111W 699 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 MRPL23YOR150W 492 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 PPM2YOL141W 2088 nt5.86□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 RBS1YDL189W 1374 nt5.85□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 YOL036WYOL036W 2286 nt5.85□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 KDX1YKL161C 1302 nt5.85□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 COX16YJL003W 357 nt5.85□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 RNH1YMR234W 1047 nt5.85□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 DFR1YOR236W 636 nt5.85□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 YTH1YPR107C 627 nt5.85□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 TRP5YGL026C 2124 nt5.84□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 DUG1YFR044C 1446 nt5.84□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 PEX31YGR004W 1389 nt5.84□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 MRPL35YDR322W 1104 nt5.84□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 COG1YGL223C 1254 nt5.84□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 CWC27YPL064C 906 nt5.84□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 MRP51YPL118W 1035 nt5.84□□□□□ -1.47
HMS1Q12398 CRZ1YNL027W 2037 nt5.84□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 GCN3YKR026C 918 nt5.83□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 OPI8YKR035C 642 nt5.83□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 XBP1YIL101C 1944 nt5.83□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 PPM1YDR435C 987 nt5.82□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 HIS1YER055C 894 nt5.82□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 DID2YKR035W-A 615 nt5.82□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 TAF9YMR236W 474 nt5.82□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 MRPS18YNL306W 654 nt5.82□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 SAL1YNL083W 1485 nt5.82□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 COX10YPL172C 1389 nt5.81□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 FAF1YIL019W 1041 nt5.81□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.81□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 CIS3YJL158C 684 nt5.81□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 RPL5YPL131W 894 nt5.81□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 HDA1YNL021W 2121 nt5.81□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 YMR279CYMR279C 1623 nt5.81□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 YHK8YHR048W 1545 nt5.8□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 HEM2YGL040C 1029 nt5.8□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 DYS1YHR068W 1164 nt5.8□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 YRB2YIL063C 984 nt5.8□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 MIA40YKL195W 1212 nt5.8□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 YFR006WYFR006W 1608 nt5.8□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 SCT1YBL011W 2280 nt5.79□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 HAS1YMR290C 1518 nt5.79□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 GEX1YCL073C 1848 nt5.79□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 GEX2YKR106W 1848 nt5.79□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 GCG1YER163C 699 nt5.79□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 ATG36YJL185C 882 nt5.79□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 RFC4YOL094C 972 nt5.79□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 IMA5YJL216C 1746 nt5.79□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 HEM1YDR232W 1647 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 YDR415CYDR415C 1125 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 GEP5YLR091W 882 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 YAR064WYAR064W 300 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 EDE1YBL047C 4146 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 TOS6YNL300W 309 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 YPL257WYPL257W 582 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 TKL1YPR074C 2043 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 ILV6YCL009C 930 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 GPB2YAL056W 2643 nt5.78□□□□□ -1.48
HMS1Q12398 FAT3YKL187C 2253 nt5.77□□□□□ -1.49
HMS1Q12398 TIM22YDL217C 624 nt5.77□□□□□ -1.49
HMS1Q12398 FAL1YDR021W 1200 nt5.77□□□□□ -1.49
HMS1Q12398 YJR107WYJR107W 987 nt5.77□□□□□ -1.49
HMS1Q12398 YJR146WYJR146W 354 nt5.77□□□□□ -1.49
HMS1Q12398 YKR032WYKR032W 315 nt5.77□□□□□ -1.49
HMS1Q12398 RHO4YKR055W 876 nt5.77□□□□□ -1.49
HMS1Q12398 CUE4YML101C 354 nt5.77□□□□□ -1.49
HMS1Q12398 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.77□□□□□ -1.49
HMS1Q12398 EMW1YNL313C 2715 nt5.76□□□□□ -1.49
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