Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YJR146WYJR146W 354 nt6.46□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 FBA1YKL060C 1080 nt6.46□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 RRN10YBL025W 438 nt6.46□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YNL120CYNL120C 486 nt6.46□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 PMT3YOR321W 2262 nt6.46□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 ATF1YOR377W 1578 nt6.45□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 TAF9YMR236W 474 nt6.45□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.45□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YPL257WYPL257W 582 nt6.45□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 PRP2YNR011C 2631 nt6.45□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 AIM3YBR108W 2844 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 ARP3YJR065C 1350 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 FZF1YGL254W 900 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YAR064WYAR064W 300 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 CUE4YML101C 354 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 FET4YMR319C 1659 nt6.44□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 CHS5YLR330W 2016 nt6.43□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 MSY1YPL097W 1479 nt6.43□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 FAL1YDR021W 1200 nt6.43□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 SUR7YML052W 909 nt6.43□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.43□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 MRPS18YNL306W 654 nt6.43□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 THI2YBR240C 1353 nt6.43□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 TRR1YDR353W 960 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 GCG1YER163C 699 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YLR312CYLR312C 1197 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YOR111WYOR111W 699 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 CTF19YPL018W 1110 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 GPD2YOL059W 1323 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 CCT8YJL008C 1707 nt6.42□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YGR054WYGR054W 1929 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 MPA43YNL249C 1629 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 SQT1YIR012W 1296 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 TSR2YLR435W 618 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 OGG1YML060W 1131 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 KSH1YNL024C-A 219 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 COX5AYNL052W 462 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 ILV6YCL009C 930 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 SPS22YCL048W 1392 nt6.41□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 ARE2YNR019W 1929 nt6.4□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 VMA3YEL027W 483 nt6.4□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 LYS1YIR034C 1122 nt6.4□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 YKR045CYKR045C 552 nt6.4□□□□□ -1.38
UBX3Q12229 ERG8YMR220W 1356 nt6.4□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 JIP4YDR475C 2631 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 OM45YIL136W 1182 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 MDE1YJR024C 735 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 MHT1YLL062C 975 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 KDX1YKL161C 1302 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 ARG81YML099C 2643 nt6.39□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 RPP1YHR062C 882 nt6.38□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 MSO1YNR049C 633 nt6.38□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 UTR2YEL040W 1404 nt6.38□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 MKK1YOR231W 1527 nt6.38□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 YFR006WYFR006W 1608 nt6.38□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 AGP2YBR132C 1791 nt6.38□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 DAL4YIR028W 1908 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 ELP3YPL086C 1674 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 SES1YDR023W 1389 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 YFL052WYFL052W 1398 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 CTF8YHR191C 402 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 SRL2YLR082C 1179 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 YLR123CYLR123C 330 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 LDB16YCL005W 771 nt6.37□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 GAA1YLR088W 1845 nt6.36□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 CMR1YDL156W 1569 nt6.36□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 AIM24YJR080C 1185 nt6.36□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 PUS5YLR165C 765 nt6.36□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 RSP5YER125W 2430 nt6.35□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.35□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.35□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 RUF23RUF23 254 nt6.35□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 YBL112CYBL112C 318 nt6.35□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 CCC2YDR270W 3015 nt6.34□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 ICL2YPR006C 1728 nt6.34□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 TFC6YDR362C 2019 nt6.34□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 BNS1YGR230W 414 nt6.34□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 GTO3YMR251W 1101 nt6.34□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 PTC4YBR125C 1182 nt6.34□□□□□ -1.39
UBX3Q12229 AIM20YIL158W 615 nt6.33□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 YKL153WYKL153W 510 nt6.33□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 REC114YMR133W 1287 nt6.33□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 COQ3YOL096C 939 nt6.33□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 RKI1YOR095C 777 nt6.33□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 ECM31YBR176W 939 nt6.33□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 SGF29YCL010C 780 nt6.33□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 OPT1YJL212C 2400 nt6.33□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 PEX3YDR329C 1326 nt6.32□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 IMG1YCR046C 510 nt6.32□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 YMR252CYMR252C 405 nt6.32□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 YBR027CYBR027C 333 nt6.32□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 GYP8YFL027C 1494 nt6.32□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 PMP3YDR276C 168 nt6.31□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 MEH1YKR007W 555 nt6.31□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.31□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 PTC3YBL056W 1407 nt6.31□□□□□ -1.4
UBX3Q12229 YDR187CYDR187C 519 nt6.3□□□□□ -1.4
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