Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4XP62701 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4XP62701 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS4XP62701 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms