Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC12A2P55011 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC12A2P55011 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms