Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 IMD1YAR073W 1212 nt6.01□□□□□ -1.45
SEH1P53011 CUE4YML101C 354 nt6.01□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YBR226CYBR226C 411 nt6.01□□□□□ -1.45
SEH1P53011 RIO1YOR119C 1455 nt6.01□□□□□ -1.45
SEH1P53011 GPH1YPR160W 2709 nt6□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YHK8YHR048W 1545 nt6□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YRB2YIL063C 984 nt6□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YMR252CYMR252C 405 nt6□□□□□ -1.45
SEH1P53011 HBN1YCL026C-B 582 nt6□□□□□ -1.45
SEH1P53011 COX10YPL172C 1389 nt6□□□□□ -1.45
SEH1P53011 SLA2YNL243W 2907 nt6□□□□□ -1.45
SEH1P53011 ALT2YDR111C 1524 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YLL066CYLL066C 3618 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 KTR5YNL029C 1569 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YBR241CYBR241C 1467 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 HIS1YER055C 894 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 ATG36YJL185C 882 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 MHT1YLL062C 975 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YAR064WYAR064W 300 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 TSR2YLR435W 618 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 RGD2YFL047W 2145 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 ISC1YER019W 1434 nt5.99□□□□□ -1.45
SEH1P53011 TAH11YJR046W 1815 nt5.98□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.98□□□□□ -1.45
SEH1P53011 YBL070CYBL070C 321 nt5.98□□□□□ -1.45
SEH1P53011 IRC11YOR013W 471 nt5.98□□□□□ -1.45
SEH1P53011 CCT3YJL014W 1605 nt5.98□□□□□ -1.45
SEH1P53011 PHO3YBR092C 1404 nt5.98□□□□□ -1.45
SEH1P53011 NTG1YAL015C 1200 nt5.97□□□□□ -1.45
SEH1P53011 ATP4YPL078C 735 nt5.97□□□□□ -1.45
SEH1P53011 OSW2YLR054C 2175 nt5.97□□□□□ -1.45
SEH1P53011 RGD1YBR260C 2001 nt5.96□□□□□ -1.45
SEH1P53011 ARP3YJR065C 1350 nt5.96□□□□□ -1.45
SEH1P53011 STT3YGL022W 2157 nt5.96□□□□□ -1.46
SEH1P53011 CCP1YKR066C 1086 nt5.96□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YMR122CYMR122C 375 nt5.96□□□□□ -1.46
SEH1P53011 RFC4YOL094C 972 nt5.96□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YBR027CYBR027C 333 nt5.96□□□□□ -1.46
SEH1P53011 GPD2YOL059W 1323 nt5.96□□□□□ -1.46
SEH1P53011 MIP1YOR330C 3765 nt5.95□□□□□ -1.46
SEH1P53011 MAK32YCR019W 1092 nt5.95□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YKR045CYKR045C 552 nt5.95□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YNL017CYNL017C 339 nt5.95□□□□□ -1.46
SEH1P53011 CDC16YKL022C 2523 nt5.95□□□□□ -1.46
SEH1P53011 SKN1YGR143W 2316 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 MKK1YOR231W 1527 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 PAT1YCR077C 2391 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 CCT8YJL008C 1707 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 RRP9YPR137W 1722 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.94□□□□□ -1.46
SEH1P53011 VMA3YEL027W 483 nt5.93□□□□□ -1.46
SEH1P53011 SCS7YMR272C 1155 nt5.93□□□□□ -1.46
SEH1P53011 DFR1YOR236W 636 nt5.93□□□□□ -1.46
SEH1P53011 CTF19YPL018W 1110 nt5.93□□□□□ -1.46
SEH1P53011 OPI11YPR044C 354 nt5.93□□□□□ -1.46
SEH1P53011 CDC1YDR182W 1476 nt5.93□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YEL020CYEL020C 1683 nt5.93□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YPR204WYPR204W 3099 nt5.93□□□□□ -1.46
SEH1P53011 GSH1YJL101C 2037 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 GEF1YJR040W 2340 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YDR387CYDR387C 1668 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 PPH22YDL188C 1134 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 FAL1YDR021W 1200 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YDR187CYDR187C 519 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 CUP2YGL166W 678 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YUR1YJL139C 1287 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 TDH2YJR009C 999 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 MIA40YKL195W 1212 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 DID2YKR035W-A 615 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YLR463CYLR463C 552 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YNR014WYNR014W 639 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 POX1YGL205W 2247 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 UIP5YKR044W 1332 nt5.92□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YPL277CYPL277C 1464 nt5.91□□□□□ -1.46
SEH1P53011 HSP12YFL014W 330 nt5.91□□□□□ -1.46
SEH1P53011 RRP46YGR095C 672 nt5.91□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YIL077CYIL077C 963 nt5.91□□□□□ -1.46
SEH1P53011 COX16YJL003W 357 nt5.91□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YJR146WYJR146W 354 nt5.91□□□□□ -1.46
SEH1P53011 GCN3YKR026C 918 nt5.91□□□□□ -1.46
SEH1P53011 YPL257WYPL257W 582 nt5.91□□□□□ -1.46
SEH1P53011 SKI2YLR398C 3864 nt5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31 ms