Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl5P47962 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl5P47962 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpl5P47962 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl5P47962 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl5P47962 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl5P47962 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl5P47962 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpl5P47962 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpl5P47962 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpl5P47962 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpl5P47962 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms