Protein–RNA interactions for Protein: P39543

SOP4, Protein SOP4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4P39543 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.09□□□□□ -1.43
SOP4P39543 PTH2YBL057C 627 nt6.09□□□□□ -1.43
SOP4P39543 HXT17YNR072W 1695 nt6.09□□□□□ -1.43
SOP4P39543 SWD1YAR003W 1281 nt6.08□□□□□ -1.44
SOP4P39543 YLR162WYLR162W 357 nt6.08□□□□□ -1.44
SOP4P39543 ATP4YPL078C 735 nt6.08□□□□□ -1.44
SOP4P39543 HXT2YMR011W 1626 nt6.07□□□□□ -1.44
SOP4P39543 ATF1YOR377W 1578 nt6.07□□□□□ -1.44
SOP4P39543 YML6YML025C 861 nt6.07□□□□□ -1.44
SOP4P39543 RKI1YOR095C 777 nt6.07□□□□□ -1.44
SOP4P39543 COX10YPL172C 1389 nt6.06□□□□□ -1.44
SOP4P39543 KAE1YKR038C 1161 nt6.06□□□□□ -1.44
SOP4P39543 BSC4YNL269W 396 nt6.06□□□□□ -1.44
SOP4P39543 COQ3YOL096C 939 nt6.06□□□□□ -1.44
SOP4P39543 CST26YBR042C 1194 nt6.06□□□□□ -1.44
SOP4P39543 NUP49YGL172W 1419 nt6.06□□□□□ -1.44
SOP4P39543 PGM1YKL127W 1713 nt6.05□□□□□ -1.44
SOP4P39543 PEX3YDR329C 1326 nt6.05□□□□□ -1.44
SOP4P39543 PRY3YJL078C 2646 nt6.05□□□□□ -1.44
SOP4P39543 COX9YDL067C 180 nt6.05□□□□□ -1.44
SOP4P39543 DMA1YHR115C 1251 nt6.05□□□□□ -1.44
SOP4P39543 HXK2YGL253W 1461 nt6.04□□□□□ -1.44
SOP4P39543 ICT1YLR099C 1185 nt6.04□□□□□ -1.44
SOP4P39543 ALT2YDR111C 1524 nt6.04□□□□□ -1.44
SOP4P39543 NSE5YML023C 1671 nt6.04□□□□□ -1.44
SOP4P39543 PFK2YMR205C 2880 nt6.04□□□□□ -1.44
SOP4P39543 HRQ1YDR291W 3234 nt6.03□□□□□ -1.44
SOP4P39543 YIL055CYIL055C 1884 nt6.03□□□□□ -1.44
SOP4P39543 EDC2YER035W 438 nt6.03□□□□□ -1.44
SOP4P39543 COA1YIL157C 594 nt6.03□□□□□ -1.44
SOP4P39543 YBR284WYBR284W 2394 nt6.03□□□□□ -1.44
SOP4P39543 PXL1YKR090W 2121 nt6.02□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YPL041CYPL041C 624 nt6.02□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YPL257WYPL257W 582 nt6.02□□□□□ -1.45
SOP4P39543 MRPL1YDR116C 858 nt6.01□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YIR042CYIR042C 711 nt6.01□□□□□ -1.45
SOP4P39543 QCR8YJL166W 285 nt6.01□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YKL077WYKL077W 1179 nt6.01□□□□□ -1.45
SOP4P39543 MRPL23YOR150W 492 nt6.01□□□□□ -1.45
SOP4P39543 POP1YNL221C 2628 nt6.01□□□□□ -1.45
SOP4P39543 RGD1YBR260C 2001 nt6.01□□□□□ -1.45
SOP4P39543 FIT2YOR382W 462 nt6□□□□□ -1.45
SOP4P39543 STB5YHR178W 2232 nt6□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YML133CYML133C 4125 nt6□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YDR514CYDR514C 1452 nt6□□□□□ -1.45
SOP4P39543 MRC1YCL061C 3291 nt5.99□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YJL163CYJL163C 1668 nt5.99□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YGR127WYGR127W 939 nt5.99□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YML079WYML079W 606 nt5.99□□□□□ -1.45
SOP4P39543 ARA2YMR041C 1008 nt5.99□□□□□ -1.45
SOP4P39543 EFM3YJR129C 1020 nt5.98□□□□□ -1.45
SOP4P39543 CCP1YKR066C 1086 nt5.98□□□□□ -1.45
SOP4P39543 IES2YNL215W 963 nt5.98□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YOR268CYOR268C 399 nt5.98□□□□□ -1.45
SOP4P39543 LDB16YCL005W 771 nt5.98□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YHL017WYHL017W 1599 nt5.97□□□□□ -1.45
SOP4P39543 RIX7YLL034C 2514 nt5.97□□□□□ -1.45
SOP4P39543 MFG1YDL233W 1377 nt5.97□□□□□ -1.45
SOP4P39543 FAL1YDR021W 1200 nt5.97□□□□□ -1.45
SOP4P39543 THI4YGR144W 981 nt5.97□□□□□ -1.45
SOP4P39543 MDE1YJR024C 735 nt5.97□□□□□ -1.45
SOP4P39543 OAC1YKL120W 975 nt5.97□□□□□ -1.45
SOP4P39543 CSC1YLR241W 2349 nt5.97□□□□□ -1.45
SOP4P39543 YHK8YHR048W 1545 nt5.96□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YDR278CYDR278C 318 nt5.96□□□□□ -1.46
SOP4P39543 AGX1YFL030W 1158 nt5.96□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YML083CYML083C 1257 nt5.96□□□□□ -1.46
SOP4P39543 PRP24YMR268C 1335 nt5.96□□□□□ -1.46
SOP4P39543 CYC8YBR112C 2901 nt5.95□□□□□ -1.46
SOP4P39543 PYK2YOR347C 1521 nt5.95□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YRB2YIL063C 984 nt5.95□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.95□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YKL102CYKL102C 306 nt5.95□□□□□ -1.46
SOP4P39543 KTR1YOR099W 1182 nt5.95□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YPR076WYPR076W 375 nt5.95□□□□□ -1.46
SOP4P39543 LDB19YOR322C 2457 nt5.94□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.94□□□□□ -1.46
SOP4P39543 LCB3YJL134W 1230 nt5.94□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YAR064WYAR064W 300 nt5.94□□□□□ -1.46
SOP4P39543 RPL21AYBR191W 483 nt5.94□□□□□ -1.46
SOP4P39543 MSS1YMR023C 1581 nt5.93□□□□□ -1.46
SOP4P39543 TMT1YER175C 900 nt5.93□□□□□ -1.46
SOP4P39543 LYS1YIR034C 1122 nt5.93□□□□□ -1.46
SOP4P39543 RUF23RUF23 254 nt5.93□□□□□ -1.46
SOP4P39543 RSA4YCR072C 1548 nt5.93□□□□□ -1.46
SOP4P39543 ACS1YAL054C 2142 nt5.92□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.92□□□□□ -1.46
SOP4P39543 SML1YML058W 315 nt5.92□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YOL046CYOL046C 675 nt5.92□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YPR123CYPR123C 435 nt5.92□□□□□ -1.46
SOP4P39543 AFG1YEL052W 1530 nt5.92□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YGR054WYGR054W 1929 nt5.91□□□□□ -1.46
SOP4P39543 IRS4YKR019C 1848 nt5.91□□□□□ -1.46
SOP4P39543 snR82snR82 268 nt5.91□□□□□ -1.46
SOP4P39543 RNH1YMR234W 1047 nt5.91□□□□□ -1.46
SOP4P39543 ESC8YOL017W 2145 nt5.91□□□□□ -1.46
SOP4P39543 LAG2YOL025W 1983 nt5.91□□□□□ -1.46
SOP4P39543 YOL036WYOL036W 2286 nt5.9□□□□□ -1.46
SOP4P39543 PRE5YMR314W 705 nt5.9□□□□□ -1.46
SOP4P39543 RPS28AYOR167C 204 nt5.9□□□□□ -1.46
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