Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	YAL019W-A	YAL019W-A	570 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SHE2	P36068	QCR8	YJL166W	285 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SHE2	P36068	YKL077W	YKL077W	1179 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SHE2	P36068	PGM1	YKL127W	1713 nt		5.78	□□□□□ -1.48
SHE2	P36068	YML6	YML025C	861 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	RNH1	YMR234W	1047 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	RUF23	RUF23	254 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	BSC4	YNL269W	396 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	LDB16	YCL005W	771 nt		5.77	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	AIM3	YBR108W	2844 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	COX9	YDL067C	180 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	YDL085C-A	YDL085C-A	207 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	PUP2	YGR253C	783 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	MDE1	YJR024C	735 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	SML1	YML058W	315 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	MRPL23	YOR150W	492 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	YIL055C	YIL055C	1884 nt		5.76	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	AGX1	YFL030W	1158 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	YRB2	YIL063C	984 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	LYS1	YIR034C	1122 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	ASR1	YPR093C	867 nt		5.75	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	PFK2	YMR205C	2880 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	PPH21	YDL134C	1110 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	IES2	YNL215W	963 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	YOL046C	YOL046C	675 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	PRY3	YJL078C	2646 nt		5.74	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	FET4	YMR319C	1659 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	YHR213W-B	YHR213W-B	300 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	YAR064W	YAR064W	300 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	ARA2	YMR041C	1008 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	KTR1	YOR099W	1182 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	COX15	YER141W	1461 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	AIM46	YHR199C	933 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	LCB3	YJL134W	1230 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	Q0010	Q0010	387 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	LAT1	YNL071W	1449 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	YDR514C	YDR514C	1452 nt		5.71	□□□□□ -1.49
SHE2	P36068	EFT2	YDR385W	2529 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	EFT1	YOR133W	2529 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	COA1	YIL157C	594 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	OAC1	YKL120W	975 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	ICT1	YLR099C	1185 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	ECM31	YBR176W	939 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	POP1	YNL221C	2628 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	SLX5	YDL013W	1860 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	YDR278C	YDR278C	318 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	MEH1	YKR007W	555 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	YOX1	YML027W	1158 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	CBK1	YNL161W	2271 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	YGR054W	YGR054W	1929 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	YPR123C	YPR123C	435 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	RPL21A	YBR191W	483 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	GYP8	YFL027C	1494 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	VMA3	YEL027W	483 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	YGR127W	YGR127W	939 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	POP5	YAL033W	522 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	CTF19	YPL018W	1110 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	ARE2	YNR019W	1929 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	RGD1	YBR260C	2001 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	MRS1	YIR021W	1092 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	YKL102C	YKL102C	306 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	PRP24	YMR268C	1335 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	ACS1	YAL054C	2142 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	HXK2	YGL253W	1461 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	RPS28A	YOR167C	204 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	YHL017W	YHL017W	1599 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	LAG2	YOL025W	1983 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	THI4	YGR144W	981 nt		5.65	□□□□□ -1.5
SHE2	P36068	PGK1	YCR012W	1251 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	ZIM17	YNL310C	525 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	RBS1	YDL189W	1374 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	NMT1	YLR195C	1368 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	CSC1	YLR241W	2349 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	PYK2	YOR347C	1521 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	YOL036W	YOL036W	2286 nt		5.63	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	CCT8	YJL008C	1707 nt		5.63	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	YIR042C	YIR042C	711 nt		5.63	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	RPR1	RPR1	369 nt		5.63	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	FMP40	YPL222W	2067 nt		5.63	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	HRQ1	YDR291W	3234 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	snR82	snR82	268 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	YGL235W	YGL235W	537 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	FMO1	YHR176W	1299 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	ASF1	YJL115W	840 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	YMC1	YPR058W	924 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	STB5	YHR178W	2232 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	CRH1	YGR189C	1524 nt		5.61	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	YHR070C-A	YHR070C-A	411 nt		5.61	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	SRL2	YLR082C	1179 nt		5.61	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	YML083C	YML083C	1257 nt		5.61	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	MSO1	YNR049C	633 nt		5.61	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	VPS5	YOR069W	2028 nt		5.61	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	RSA4	YCR072C	1548 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	AFG1	YEL052W	1530 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	PPT1	YGR123C	1542 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	MKK1	YOR231W	1527 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	EXG1	YLR300W	1347 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	VPS4	YPR173C	1314 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	HOC1	YJR075W	1191 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SHE2	P36068	CCP1	YKR066C	1086 nt		5.6	□□□□□ -1.51

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