Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFEBP19484 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFEBP19484 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFEBP19484 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFEBP19484 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFEBP19484 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFEBP19484 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFEBP19484 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFEBP19484 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFEBP19484 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFEBP19484 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TFEBP19484 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFEBP19484 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFEBP19484 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFEBP19484 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFEBP19484 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFEBP19484 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFEBP19484 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFEBP19484 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFEBP19484 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFEBP19484 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFEBP19484 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFEBP19484 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TFEBP19484 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFEBP19484 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFEBP19484 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFEBP19484 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFEBP19484 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TFEBP19484 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFEBP19484 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFEBP19484 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFEBP19484 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFEBP19484 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFEBP19484 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFEBP19484 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFEBP19484 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TFEBP19484 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFEBP19484 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFEBP19484 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFEBP19484 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFEBP19484 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFEBP19484 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFEBP19484 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFEBP19484 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFEBP19484 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFEBP19484 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFEBP19484 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFEBP19484 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFEBP19484 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFEBP19484 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFEBP19484 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFEBP19484 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFEBP19484 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TFEBP19484 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TFEBP19484 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFEBP19484 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFEBP19484 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFEBP19484 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TFEBP19484 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFEBP19484 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFEBP19484 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFEBP19484 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFEBP19484 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFEBP19484 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFEBP19484 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFEBP19484 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFEBP19484 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TFEBP19484 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFEBP19484 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFEBP19484 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TFEBP19484 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFEBP19484 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFEBP19484 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFEBP19484 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TFEBP19484 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFEBP19484 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFEBP19484 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFEBP19484 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFEBP19484 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFEBP19484 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TFEBP19484 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TFEBP19484 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFEBP19484 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFEBP19484 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFEBP19484 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFEBP19484 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFEBP19484 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFEBP19484 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFEBP19484 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TFEBP19484 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFEBP19484 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFEBP19484 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFEBP19484 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFEBP19484 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFEBP19484 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFEBP19484 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFEBP19484 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFEBP19484 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFEBP19484 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFEBP19484 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms