Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FAM228BP0C875 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM228BP0C875 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM228BP0C875 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM228BP0C875 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms