Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf25B1AWN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf25B1AWN9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf25B1AWN9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf25B1AWN9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf25B1AWN9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf25B1AWN9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf25B1AWN9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf25B1AWN9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf25B1AWN9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf25B1AWN9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms