Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6F4

TRBV21OR9-2, T-cell receptor beta variable 21/OR9-2 (pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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