Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms