Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR3

TBX20, T-box transcription factor TBX20, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX20Q9UMR3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TBX20Q9UMR3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TBX20Q9UMR3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TBX20Q9UMR3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TBX20Q9UMR3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TBX20Q9UMR3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TBX20Q9UMR3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TBX20Q9UMR3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TBX20Q9UMR3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TBX20Q9UMR3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TBX20Q9UMR3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms