Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms