Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms