Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MBD5Q9P267 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD5Q9P267 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms