Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms