Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms