Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELL3Q9HB65 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 521.3 ms