Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms