Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM54Q9BYV2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms