Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCD2Q9BXW9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCD2Q9BXW9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms