Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRIP1Q9BX63 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms