Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms