Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3R4Q99570 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms