Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NSMCE2Q96MF7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms