Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC009245.1-201ENST00000456481 862 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC008840.1-201ENST00000512486 809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MS4A3Q96HJ5 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms