Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC41A3Q96GZ6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms