Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S1Q92572 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S1Q92572 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms