Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms