Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP31Q70CQ4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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