Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PERM1Q5SV97 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms