Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC38Q502W7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms