Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KHDC1Q4VXA5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KHDC1Q4VXA5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms