Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDB1Q16531 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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