Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A3Q14050 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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