Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TUBB3Q13509 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TUBB3Q13509 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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