Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCIRG1Q13488 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCIRG1Q13488 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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