Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMS2P3Q13401 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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