Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms