Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN3Q13286 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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