Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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