Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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SEMA3BQ13214 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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