Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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NR1H3Q13133 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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NR1H3Q13133 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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