Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RESTQ13127 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RESTQ13127 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RESTQ13127 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RESTQ13127 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RESTQ13127 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RESTQ13127 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RESTQ13127 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RESTQ13127 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RESTQ13127 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RESTQ13127 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RESTQ13127 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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RESTQ13127 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RESTQ13127 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RESTQ13127 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RESTQ13127 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms