Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
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GRIN2AQ12879 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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GRIN2AQ12879 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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GRIN2AQ12879 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN2AQ12879 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
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GRIN2AQ12879 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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GRIN2AQ12879 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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GRIN2AQ12879 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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GRIN2AQ12879 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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GRIN2AQ12879 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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GRIN2AQ12879 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2AQ12879 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
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