Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms