Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALD1Q05682 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms